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Signature of mid-Pleistocene lineages in the European silver fir (Abies alba Mill.) at its geographic distribution margin / Caroline Scotti-Saintagne in Ecology and evolution, 11 (16) (2021) 

Public Citation [article]  inEcology and evolution > 11 (16) (2021) . - 10984-10999 Titre : Signature of mid-Pleistocene lineages in the European silver fir (Abies alba Mill.) at its geographic distribution margin Type de document : Imprimé Auteurs : Caroline Scotti-Saintagne ; Thomas Boivin ; Marie Suez ; Brigitte Musch ; Ivan Scotti ; Bruno Fady (1960-) Année de publication : 2021 Article en page(s) : 10984-10999 Langues : Anglais (eng) Catégories : [CBNPMP-Thématique] Plantes subspontanées, naturalisées, envahissantes Mots-clés : Abies alba Miller Résumé : In a conservation and sustainable management perspective, we identify the ecological, climatic, and demographic factors responsible for the genetic diversity patterns of the European silver fir (Abies alba Mill.) at its southwestern range margin (Pyrenees Mountains, France, Europe). We sampled 45 populations throughout the French Pyrenees and eight neighboring reference populations in the Massif Central, Alps, and Corsica. We genotyped 1,620 individuals at three chloroplast and ten nuclear microsatellite loci. We analyzed within- and among-population genetic diversity using phylogeographic reconstructions, tests of isolation-by-distance, Bayesian population structure inference, modeling of demographic scenarios, and regression analyses of genetic variables with current and past environmental variables. Genetic diversity decreased from east to west suggesting isolation-by-distance from the Alps to the Pyrenees and from the Eastern to the Western Pyrenees. We identified two Pyrenean lineages that diverged from a third Alpine–Corsica–Massif Central lineage 0.8 to 1.1 M years ago and subsequently formed a secondary contact zone in the Central Pyrenees. Population sizes underwent contrasted changes, with a contraction in the west and an expansion in the east. Glacial climate affected the genetic composition of the populations, with the western genetic cluster only observed in locations corresponding to the coldest past climate and highest elevations. The eastern cluster was observed over a larger range of temperatures and elevations. All demographic events shaping the current spatial structure of genetic diversity took place during the Mid-Pleistocene Transition, long before the onset of the Holocene. The Western Pyrenees lineage may require additional conservation efforts, whereas the eastern lineage is well protected in in situ gene conservation units. Due to past climate oscillations and the likely emergence of independent refugia, east–west oriented mountain ranges may be important reservoir of genetic diversity in a context of past and ongoing climate change in Europe. Identifiant : DOI : 10.1002/ece3.7886 Permalink : https://biblio.cbnpmp.fr/index.php?lvl=notice_display&id=155363 Scotti-Saintagne, Caroline, Boivin, Thomas, Suez, Marie, Musch, Brigitte, Scotti, Ivan, Fady, Bruno (1960-) 2021 Signature of mid-Pleistocene lineages in the European silver fir (Abies alba Mill.) at its geographic distribution margin. Ecology and evolution, 11(16): 10984-10999.

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A synthesis of biological invasion hypotheses associated with the introduction–naturalisation–invasion continuum / Ella Z. Daly in Oikos, 2023 (2023) 

Public Citation [article]  inOikos > 2023 (2023) . - e09645 Titre : A synthesis of biological invasion hypotheses associated with the introduction–naturalisation–invasion continuum Type de document : Imprimé Auteurs : Ella Z. Daly ; Olivier Chabrerie (1976-) ; François Massol ; Benoît Facon ; Manon C. M. Hess ; Aurélie Tasiemski ; Frédéric Grandjean ; Mathieu Chauvat ; Frédérique Viard ; Estelle Forey ; Laurent Folcher ; Elise Buisson (1977-) ; Thomas Boivin ; Sylvie Baltora-Rosset ; Romain Ulmer ; Patricia Gibert ; Gabrielle Thiébaut ; Jelena H. Plantel ; Tina Heger (1970-) ; David Mark Richardson (1958-) ; David Renault Année de publication : 2023 Article en page(s) : e09645 Langues : Français (fre) Catégories : [CBNPMP-Thématique] Plantes subspontanées, naturalisées, envahissantes Résumé : With the advent of the Anthropocene, biological invasions have reached an unprecedented level, and the number of species introductions is still increasing in an everchanging world. Despite major advances in invasion science, significant debate and lack of clarity remain surrounding the determinants of success of introduced species, the magnitude and dimensions of their impact, and the mechanisms sustaining successful invasions. Empirical studies show divergent impacts of alien populations on ecosystems and contrasting effects of biotic and abiotic factors on the dynamics of alien populations, which hinders the creation of a unified theory of biological invasions. Compounding these issues is the plethora of hypotheses that aim to explain invasion success, which can be unclear and contradictory. We propose a synthesis that categorizes hypotheses along a timeline of invasion. We sorted invasion hypotheses along the invasion timeline, and considered population, community and ecosystem levels. This temporal sorting of invasion concepts shows that each is relevant at a specific stage of the invasion. Although concepts and empirical findings on alien species may appear contradictory, when mapped onto an invasion timeline, they may be combined in a complementary way. An overall scheme is proposed to summarise the theoretical dynamics of ecosystems subjected to invasions. For any given case study, this framework provides a guide through the maze of theories and should help choose the appropriate concepts according to the stage of invasion. Identifiant : DOI : 10.1111/oik.09645 Permalink : https://biblio.cbnpmp.fr/index.php?lvl=notice_display&id=148974 Daly, Ella Z., Chabrerie, Olivier (1976-), Massol, François, Facon, Benoît, Hess, Manon C. M., Tasiemski, Aurélie, Grandjean, Frédéric, Chauvat, Mathieu, Viard, Frédérique, Forey, Estelle, Folcher, Laurent, Buisson, Elise (1977-), Boivin, Thomas, Baltora-Rosset, Sylvie, Ulmer, Romain, Gibert, Patricia, Thiébaut, Gabrielle, Plantel, Jelena H., Heger, Tina (1970-), Richardson, David Mark (1958-), Renault, David 2023 A synthesis of biological invasion hypotheses associated with the introduction–naturalisation–invasion continuum. Oikos, 2023: e09645.

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Valoriser et renforcer les mécanismes d’évolution génétique par la sylviculture, pour l’adaptation au changement climatique / François Lefèvre in Revue forestière française, 72 (5) (2020) 

Public Citation [article]  inRevue forestière française > 72 (5) (2020) . - 383-410 Titre : Valoriser et renforcer les mécanismes d’évolution génétique par la sylviculture, pour l’adaptation au changement climatique Type de document : Numérique Auteurs : François Lefèvre ; Thomas Boivin ; Aurore Bontemps ; François Courbet ; Hendrik Davi ; Marion Durand-Gillmanna ; Bruno Fady (1960-) ; Julie Gauzerea ; Cindy Gidoina ; Marie-Joe Karama ; Hadrien Lalagüea ; Sylvie Oddou-Muratorio ; Christian Pichota Année de publication : 2020 Article en page(s) : 383-410 Langues : Français (fre) Catégories : [CBNPMP-Thématique] Génétique et écologie (dynamique, démographique, sélection) [CBNPMP-Thématique] Relations climat-végétation [CBNPMP-Thématique] Forêt Résumé : L’adaptation est un enjeu majeur de la gestion forestière dans le contexte du changement climatique La diversité génétique qui caractérise les arbres forestiers leur confère un potentiel adaptatif très important mais pas illimité Prendre en compte les mécanismes de l’évolution dans les pratiques de gestion forestière adaptative renforcera la capacité des forêts gérées à répondre aux changements et aux aléas induits par le climat. En mettant l’accent sur le cas des forêts en régénération naturelle, nous proposons un cadre conceptuel général permettant d’intégrer la connaissance de ces mécanismes dans la prise de décision, dans une démarche de sylviculture par et pour l’évolution Ce cadre général pourra être décliné dans des situations locales diverses et complexes en s’appuyant sur la connaissance du contexte qu’ont les gestionnaires forestiers Nous développons une grille d’analyse simple, basée sur un petit nombre de paramètres caractérisant les mécanismes de l’évolution, pour comprendre l’impact des pratiques sylvicoles sur la dynamique de la diversité génétique et le maintien du potentiel d’évolution des populations d’arbres forestiers Après avoir rappelé l’état des connaissances sur les mécanismes de l’évolution chez les arbres forestiers, nous examinons les effets attendus de pratiques forestières actuelles ou innovantes sur ces mécanismes Pour illustrer la complexité des mécanismes en interaction, nous développons plus en détail les conséquences évolutives des interactions biotiques et celles d’un environnement fortement hétérogène La sylviculture par et pour l’évolution peut contribuer à l’adaptation des forêts au changement climatique Elle nécessite de combiner des objectifs à court et à long terme Nous proposons des pistes de recherche et d’expérimentation pour accompagner cette démarche. Identifiant : HAL : hal-03273194 Permalink : https://biblio.cbnpmp.fr/index.php?lvl=notice_display&id=145167 Lefèvre, François, Boivin, Thomas, Bontemps, Aurore, Courbet, François, Davi, Hendrik, Durand-Gillmanna, Marion, Fady, Bruno (1960-), Gauzerea, Julie, Gidoina, Cindy, Karama, Marie-Joe, Lalagüea, Hadrien, Oddou-Muratorio, Sylvie, Pichota, Christian 2020 Valoriser et renforcer les mécanismes d’évolution génétique par la sylviculture, pour l’adaptation au changement climatique. Revue forestière française, 72(5): 383-410.

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