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eDNA Increases the Detectability of Ranavirus Infection in an Alpine Amphibian Population / Claude Miaud in Viruses, 11(6) (526) (2019)
[article]
Titre : eDNA Increases the Detectability of Ranavirus Infection in an Alpine Amphibian Population Type de document : Imprimé Auteurs : Claude Miaud ; Véronique Arnal ; Marie Poulain ; Alice Valentini ; Tony Dejean Année de publication : 2019 Langues : Anglais (eng) Catégories : [CBNPMP-Thèmes] Lac d'altitude Résumé : The early detection and identification of pathogenic microorganisms is essential in order to deploy appropriate mitigation measures. Viruses in the Iridoviridae family, such as those in the Ranavirus genus, can infect amphibian species without resulting in mortality or clinical signs, and they can also infect other hosts than amphibian species. Diagnostic techniques allowing the detection of the pathogen outside the period of host die-off would thus be of particular use. In this study, we tested a method using environmental DNA (eDNA) on a population of common frogs (Rana temporaria) known to be affected by a Ranavirus in the southern Alps in France. In six sampling sessions between June and September (the species’ activity period), we collected tissue samples from dead and live frogs (adults and tadpoles), as well as insects (aquatic and terrestrial), sediment, and water. At the beginning of the breeding season in June, one adult was found dead; at the end of July, a mass mortality of tadpoles was observed. The viral DNA was detected in both adults and tadpoles (dead or alive) and in water samples, but it was not detected in insects or sediment. In live frog specimens, the virus was detected from June to September and in water samples from August to September. Dead tadpoles that tested positive for Ranavirus were observed only on one date (at the end of July). Our results indicate that eDNA can be an effective alternative to tissue/specimen sampling and can detect Ranavirus presence outside die-offs. Another advantage is that the collection of water samples can be performed by most field technicians. This study confirms that the use of eDNA can increase the performance and accuracy of wildlife health status monitoring and thus contribute to more effective surveillance programs. Lien pérenne : DOI : 10.3390/v11060526 Permalink : https://biblio.cbnpmp.fr/index.php?lvl=notice_display&id=152375
in Viruses > 11(6) (526) (2019)Miaud, C., Arnal, V., Poulain, M., Valentini, A., Dejean, T. 2019. eDNA Increases the Detectability of Ranavirus Infection in an Alpine Amphibian Population. Viruses, 11(6)(526).Documents numériques
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Article (2019)URL Effects of building up a dam in a shallow montain lake (Baciver, Central Pyrennees) / Enric Ballesteros (1998)
Titre : Effects of building up a dam in a shallow montain lake (Baciver, Central Pyrennees) Type de document : Tiré à part de revue Auteurs : Enric Ballesteros (1958-) ; Esperança Gacia i Passola Année de publication : 1998 Importance : 55-66 Langues : Anglais (eng) Catégories : [CBNPMP-Géographique] Baciver
[CBNPMP-Géographique] Pyrénées centrales
[CBNPMP-Géographique] Val d'Aran
[CBNPMP-Thèmes] Enjeux de conservation des lacs d'altitude
[CBNPMP-Thèmes] Impact sur l'hydrologie fluviale et lacustre
[CBNPMP-Thèmes] Lac d'altitudeMots-clés : Littorelletea Isoëtes Résumé : Efectos del represamiento de un lago somero de montaña (Baciver, Pirineos centrales). Se estudiaron los cambios en el agua, el sedimento y la estructura y dinámica de las poblaciones de macrófitos sumergidos después del represamiento de un lago de alta montaña de los Pirineos a finales del verano de 1990. Las variaciones más notables de las características físicas y químicas fueron: a) elevación de 5,5 m del nivel del litoral; b) disminución de la transmitancia de la luz en la columna de agua; c) depleción de oxígeno en las aguas profundas, junto a la reducción del pH y al aumento de la conductividad y de la concentración de cationes; d) aumento de la concentración de nitrógeno disuelto total (principalmente amonio) y de fósforo en la columna de agua, y e) aumento de los compuestos de N reducidos (nitrito y amonio) en el agua intersticial de la comunidad de Isoetes lacustris, ligada a una disminución del nitrato. Los cambios en las características químicas parecen estar relacionados con la descomposición de la materia orgánica aportada por los prados y matorrales subalpinos terrestres, así como por la vegetación sumergida del lago. Tanto el área ocupada por la vegetación sumergida como el número de especies de macrófitos experimentaron una importante reducción con el represamiento del lago Baciver. Todas las especies pequeñas, no dominantes (Eleocharis acicularis, Subularia aquatica e Isoetes setacea), desaparecieron a lo largo del verano de 1991. Sparganium angustifolium experimentó un proceso de degradación (baja densidad de pies, hojas cortas) en 1991 que condujo a su completa desaparición en la primavera de 1992. La fuerte atenuación del régimen de iluminación podría explicar dichas pérdidas. Los individuos de Isoetes lacustris que originalmente vivían por debajo de los 0,6 m de profundidad estaban completamente muertos en el verano de 1991, probablemente debido a la depleción invernal de oxígeno. Las únicas plantas de Isoetes que sobrevivieron (las que originalmente vivían por encima de los 0,6 m de profundidad y que después del represamiento se hallaban entre 5,8 y 6,1 m) aumentaron su longitud foliar como respuesta a la reducción de irradiancia disponible. Aunque el número de hojas producidas fue ligeramente menor en 1991 de lo que era antes del represamiento, la biomasa producida aumentó, pues las hojas eran más largas. Sin embargo, la pérdida de hojas fue muy grande, lo que produjo una reducción global de la población. A finales de la primavera de 1992, los Isoetes lacustris supervivientes tenían las hojas restantes muy dañadas, probablemente debido a la anoxia invernal, y no se produjo ninguna hoja nueva en el verano de 1992. Esto condujo a la desaparición total de la comunidad en el lago. Permalink : https://biblio.cbnpmp.fr/index.php?lvl=notice_display&id=131057 Ballesteros, E., Gacia i Passola, E. 1998. Effects of building up a dam in a shallow montain lake (Baciver, Central Pyrennees). Oecologia aquatica, 11 : 55-66.Documents numériques
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Article (1998)Adobe Acrobat PDF Effects of wind-induced sediment resuspension on distribution and morphological traits of aquatic weeds in shallow lakes / Vincent Bertrin in Journal of limnology, 76 (1) (2017)
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Titre : Effects of wind-induced sediment resuspension on distribution and morphological traits of aquatic weeds in shallow lakes Type de document : Imprimé Auteurs : Vincent Bertrin (1978-) ; Sébastien Boutry ; Gwilherm Jan ; Greta Ducasse ; Florent Grigoletto ; Cristina Ribaudo Année de publication : 2017 Langues : Anglais (eng) Catégories : [CBNPMP-Thèmes] Enjeux de conservation des lacs d'altitude
[CBNPMP-Thèmes] Lac d'altitudeRésumé : The spread of invasive aquatic plants (i.e., aquatic weeds) requires a broader knowledge of the factors determining their settlement at the lake scale, in order to improve management practices and biomonitoring. Among hydrodynamic pressures, wave action might influence submerged vegetation distribution in shallow lakes and potentially engender modifications of plant morphological traits. We here report a field survey conducted between 2014 and 2015 in French Atlantic Lakes to assess the spatial distribution and biomass production of two rooted aquatic weeds, Egeria densa Planch. and Lagarosiphon major (Ridl.) Moss, in relation to wind-induced sediment resuspension, water depth and sedimentary features. Moreover, we explored the relation between plant morphological traits and hydrodynamic disturbance under in situ conditions. At the lake scale, E. densa and L. major formed extensive monospecific stands, and occurred in the same areas only at low biomass. Both monospecific and mixed stands preferentially developed in shallow-sheltered or deep-exposed areas. Plant morphological traits showed different patterns in function of sediment resuspension according to the species and the lake. The influence of resuspension was however not systematic, with many cases where morphological traits were not affected at all. Maximum stem length appeared to be the most correlated trait towards sediment resuspension. Moreover, we found a significant correlation between the biomass and the sedimentary organic matter, indicating an interaction between the organic substrate preference of the plants and the effect of the canopy on fine particles sedimentation. On the whole, we highlighted the link between plant distribution, phenotypic plasticity and sediment resuspension, with calm-water zones favouring the settlement of dense vegetated stands. Our study could thus contribute to improve prediction models for identifying suitable areas for potential colonization by aquatic weeds. Further research is needed to better understand the role played by hydraulic forces in structuring the habitats in shallow lakes. Lien pérenne : DOI : 10.4081/jlimnol.2017.1678 Permalink : https://biblio.cbnpmp.fr/index.php?lvl=notice_display&id=150950
in Journal of limnology > 76 (1) (2017)Bertrin, V., Boutry, S., Jan, G., Ducasse, G., Grigoletto, F., Ribaudo, C. 2017. Effects of wind-induced sediment resuspension on distribution and morphological traits of aquatic weeds in shallow lakes. Journal of limnology, 76(1).Documents numériques
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Article (2017)URL L’équipement électrique des Pyrénées / Roger Brunet in Revue géographique des Pyrénées et du Sud-Ouest, 33 (1) (03/1962)
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Titre : L’équipement électrique des Pyrénées Type de document : Imprimé Auteurs : Roger Brunet Année de publication : 1962 Article en page(s) : 123-128 Langues : Français (fre) Catégories : [CBNPMP-Thèmes] Enjeux de conservation des lacs d'altitude
[CBNPMP-Thèmes] Lac d'altitudeLien pérenne : DOI : 10.3406/rgpso.1962.4542 Permalink : https://biblio.cbnpmp.fr/index.php?lvl=notice_display&id=147799
in Revue géographique des Pyrénées et du Sud-Ouest > 33 (1) (03/1962) . - 123-128Brunet, R. 1962. L’équipement électrique des Pyrénées. Revue géographique des Pyrénées et du Sud-Ouest, 33(1): 123-128.Exemplaires (1)
Code-barres Cote Support Localisation Section Disponibilité R7938 P-172 Revue Réserve Revues Consultable Documents numériques
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Article (1962)Adobe Acrobat PDF L’équipement hydro-électrique des Pyrénées espagnoles / Max Daumas in Revue géographique des Pyrénées et du Sud-Ouest, 33 (1) (03/1962)
[article]
Titre : L’équipement hydro-électrique des Pyrénées espagnoles Type de document : Imprimé Auteurs : Max Daumas Année de publication : 1962 Article en page(s) : 73-106 Langues : Français (fre) Catégories : [CBNPMP-Thèmes] Enjeux de conservation des lacs d'altitude
[CBNPMP-Thèmes] Lac d'altitudeRésumé : Malgré les progrès de l'équipement de l'ensemble du pays, les Pyrénées restent la première région hydro-électrique d'Espagne, avec le quart de la production nationale ; 92 % proviennent des Pyrénées centrales, favorisées par leurs conditions naturelles ; Garonne aranaise, Noguera Pallaresa et Noguera Ribagorzana sont les cours d'eau les mieux équipés. Les installations sont de deux types : centrales de haute chute dans la Zone axiale, centrales au pied des grands barrages-réservoirs dans les Prépyrénées. L'équipement a débuté vers 1920 et a été intensifié surtout après la guerre civile, soit par un organisme d'Etat, l'E. N. H. E. R., soit par de puissantes sociétés privées. Trop récente, trop exclusivement orientée vers les centres industriels extérieurs, surtout Barcelone, la mise en valeur hydro-électrique n'a pas entraîné l'industrialisation des Pyrénées espagnoles et de leur bordure immédiate. Lien pérenne : DOI : 10.3406/rgpso.1962.4536 Permalink : https://biblio.cbnpmp.fr/index.php?lvl=notice_display&id=147800
in Revue géographique des Pyrénées et du Sud-Ouest > 33 (1) (03/1962) . - 73-106Daumas, M. 1962. L’équipement hydro-électrique des Pyrénées espagnoles. Revue géographique des Pyrénées et du Sud-Ouest, 33(1): 73-106.Exemplaires (1)
Code-barres Cote Support Localisation Section Disponibilité R7938 P-172 Revue Réserve Revues Consultable Documents numériques
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Article (1962)Adobe Acrobat PDF Étude morphométrique et physico-chimique de neuf lacs du Massif de Néouvielle (Hautes-Pyrénées) / Jacques Capblancq in Annales de Limnologie, 4 (3) (1968)
PermalinkEvaluation scientifique de l’impact de l’hydroélectricité dans le Parc naturel régional des Pyrénées ariégeoises / Matthieu Fournier
PermalinkUne Excursion dans Le Massif de Mont-Louis pour la recherche des Isoëtes des Pyrénées-Orientales / M. le Vicomte Sébastien de Salve in Bulletin de la Société botanique de France, 12 (1865)
PermalinkFrom fish to frogs and beyond: Impact and host range of emergent ranaviruses / Stephen J. Price in Virology, 511 (2017)
PermalinkHigh mountain lakes and atmospherically transported pollutants / Richard William Battarbee (2005)
PermalinkHigh mountain lakes: extreme habitats and witnesses of environmental changes / Jordi Catalán in Limnética, 25 (1-2) (June 2006)
PermalinkHydrobiological Assessment of the High Mountain Kolsay Lakes (Kungey Alatau, Southeastern Kazakhstan) Ecosystems in Climatic Gradient / E. G. Krupa in British journal of environment and climate change, 6 (4) (2016)
PermalinkIn memoriam - l'abbé Gaurier / Club alpin Français, Section des Pyrénées centrales in Bulletin mensuel (Club Alpin Français, Section des Pyrénées Centrales), 59 (1931)
PermalinkInventaire piscicole, en 1960, des lacs de montagne des Basses et Hautes-Pyrénées / Pierre Chimits in Bulletin français de pisciculture, 197 (1960)
PermalinkUn lac oligotrophe de haute montagne : le lac Cornu (Haute-Savoie) / Gérard Balvay in Revue de géographie alpine, 66 (1) (1978)
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